Không giống như phần mềm truyền thống, thường được bán dưới dạng giấy phép vĩnh viễn với chi phí trả trước (và phí hỗ trợ liên tục tùy chọn), các nhà cung cấp SaaS thường định giá các ứng dụng sử dụng phí đăng ký, phổ biến nhất là phí hàng tháng hoặc phí hàng năm.[14] Do đó, chi phí thiết lập ban đầu cho SaaS thường thấp hơn so với phần mềm doanh nghiệp tương đương. Các nhà cung cấp SaaS thường định giá các ứng dụng của họ dựa trên một số thông số sử dụng, chẳng hạn như số lượng người dùng sử dụng ứng dụng. Tuy nhiên, vì trong môi trường SaaS, dữ liệu của khách hàng cư trú với nhà cung cấp SaaS, cơ hội cũng tồn tại để tính phí cho mỗi giao dịch, sự kiện hoặc đơn vị giá trị khác, chẳng hạn như số lượng bộ xử lý cần thiết.[15]

Chi phí tương đối thấp cho việc cung cấp người dùng (nghĩa là thiết lập một khách hàng mới) trong môi trường đa năng cho phép một số nhà cung cấp SaaS cung cấp các ứng dụng sử dụng mô hình freemium.[15] Trong mô hình này, một dịch vụ miễn phí được cung cấp với chức năng hoặc phạm vi hạn chế và phí được tính cho chức năng nâng cao hoặc phạm vi lớn hơn.[15] Một số ứng dụng SaaS khác hoàn toàn miễn phí cho người dùng, với doanh thu được lấy từ các nguồn thay thế như quảng cáo.[16]

Động lực chính cho sự phát triển của SaaS là khả năng của các nhà cung cấp SaaS trong việc cung cấp một mức giá cạnh tranh với phần mềm tại chỗ. Điều này phù hợp với lý do truyền thống để thuê ngoài hệ thống CNTT, bao gồm việc áp dụng quy mô kinh tế cho hoạt động ứng dụng, tức là, nhà cung cấp dịch vụ bên ngoài có thể cung cấp các ứng dụng tốt hơn, rẻ hơn, đáng tin cậy hơn. [cần dẫn nguồn]